Berdirinya kedokteran Universitas Kristen Duta Wacana atau yang biasa di singkat UKDW ialah atas gagasan kol (Pur) Djoko Soewindhi pada tahun 2009. Namun, gagasan pembuatan kedokteran di UKDW sudah tersusun sejak tahun 2004, namun saat itu belum mendapat persetujuan dari Departemen Pendidikan setelah mengajukan proposal. Pada tahun 2008 UKDW membuat proposal kembali dan di ajukan ke Departemen Pendidikan namun di tolak kembali, akhirnya pada akhir 2009 UKDW menyerahkan proposal.

Setelah mendapatkan izin untuk membuka program studi kedokteran dengan di keluarkannya Surat Ijin penyelenggaran yang dikeluarkan oleh Dir Jen Dikti No 1847/D/T/2009 tanggal 14 Oktober 2009. Sejak di terbitkannya surat tersebut program Studi Pendidikan Dokter di UKDW berada langsung dibawah Rektor dan telah melakukan proses pendidikan dan telah telah meluluskan 107 dokter Dengan lokasi di gedung Agape lantai 5 dan fasilitas Laboratorium yang secukupnya, proses pendidikan terus berlangsung dan terus menerus ditingkatkan.

Sejak diresmikannya Program Studi menjadi Fakultas, maka UKDW terus melakukan pembenahan dan pengembangan, termasuk peralatan, sarana prasarana dan juga SDM. Peningkatan dan perbaikan managemen, kurikulum dan penyelenggaraan pendidikan lainnya terus menjadi perhatian, termasuk penelitian dan pengabdian masyarakat. Pada tahun 2012, Program Studi Pendidikan Dokter, Fakultas Kedokteran UKDW telah lusus akreditasi yang dilakukan oleh Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi (Ban-PT) Pada saat itu memang baru ada satu Program Studi, yaitu Program Studi Pendidikan Dokter.

Kedokteran UKDW yang beralamatkan di Jl. Dr. Wahidin Sudirohusodo No. 5-25 Kotabaru, Kec. Gondokusuman, Kota Yogyakarta, Daerah Istimewa Yogyakarta ini memiliki visi untuk menjadi kampus dengan salah satu program studi kedokteran yang unggul, kompetitif, dan terpercaya, yang menghasilkan sarjana kedokteran yang berbudi luhur dan mandiri dalam bidang kesehatan untuk masyarakat yang pluralistik berdasarkan kasih.

Serta misi yang di berikan yaitu sebagai berikut:

1. Menyelenggarakan pendidikan dan pengajaran dalam bidang kedokteran yang kontekstual berbasis nilai-nilai kedutawacanaan.
2. Melaksanakan riset kedokteran yang berpihak pada nilai kemanusiaan dan menerapkan hasil riset kedokteran tersebut
3. Melaksanakan kegiatan pengabdian dalam bidang kesehatan untuk masyarakat yang pluralistik dengan berdasarkan kasih.

Serta untuk kalian yang ingin mendapatkan info yang lebih jelas dan mendetail dapat kalian buka situs https://www.ukdw.ac.id  lalu pilih kedokterannya atau dapat menghubungi nomor telepon +622745639299. Biaya yang ditawarkan oleh UKDW yaitu sebesar Rp. 190.000.000 untuk biaya awal masuk serta SPP tiap semesternya sebesar Rp. 11.000.000.